说起海兰珠，还有一段不为人知的故事。她是莽古思长子塞桑贝勒之长女，是哲哲的大侄女、布木布泰的亲姐姐。海兰珠天生丽质，品貌双全，长得极其漂亮，为人贤淑文静。在她十三岁的时候，就被装扮成新娘送到察哈尔部，嫁给林丹汗的弟弟做了一个小福晋。
林丹汗的弟弟是个不务正业、病恹恹的酒鬼，经常是喝醉了酒以后，回到蒙古包就打自己的福晋们，其中有几位福晋己被他折磨致死。海兰珠与他结婚后，也没有过上好日子，她也经常被丈夫折磨得死去活来。后来林丹汗的弟弟一命归天，剩下海兰珠孤苦一人，她便回到了科尔沁娘家生活。
哲哲心想，她和布木布泰姑侄俩都没能为皇太极生下儿子，自己虽然是中宫大妃，但将来她们姑侄在宫中的地位也不稳。她看皇太极喜欢上了海兰珠，就想促他们成婚，盼望她将来能为皇太极生个儿子，保住科尔沁同大金的血缘关系，进而保住科尔沁在大金后宫的统摄地位。
